Томские ученые ищут способ предсказывать рак по метаболомному профилю пациента

Опубликовано 11.07.2016 г.
Сибирь (в частности, бассейны рек Обь, Иртыш, Кама, Томь) является регионом, где уровень зараженности населения описторхозом может достигать 75-80%. При этом паразитарные болезни считаются факторами риска для развития рака. Ученые ТГУ, СибГМУ и Медицинского Центра Лейденского университета (Нидерланды) исследуют эту связь. Результатом исследования может стать создание новых методов неинвазивной диагностики рака желчных протоков (холангиокарциномы).

IMG_0465.JPG

Ученые исследуют продукты метаболизма человека – метаболиты.  Совокупность метаболитов – метаболом – является отражением индивидуальных особенностей (фенотипа) организма, а значит, и важным источником клинической информации для прогнозирования осложнений при различных заболеваниях, в частности, при заражении паразитами. Использование современных аналитических методов – масс-спектрометрии и ядерного магнитного резонанса (ЯМР-спектроскопии) позволяет оценивать даже самые незначительные изменения метаболомного фенотипа. 

– Современные знания в области метаболических особенностей инфекций, вызванных паразитами-гельминтами, очень фрагментарны, и еще меньше информации о гельминт-индуцированном раке, – говорит сотрудник лаборатории клинической метаболомики ТГУ Дарья Кокова. – При этом существуют убедительные доказательства, что различные гельминты по-разному влияют на организм хозяина и его метаболом.

В течение первого года проекта были проведены исследования с участием пациентов, страдающих описторхозной инвазией, и здоровых добровольцев. Исследователи работали с разнообразным  биологическим материалом,  но предпочтение было отдано образцам, забор которых возможен  неинвазивным путем. В частности, был разработан простой метод для анализа фекального материала (один из основных образцов в паразитологии),  позволяющий  идентифицировать более 60 метаболитов.  

Из общего числа ученые смогли выделить 11 метаболитов, которые могли бы объяснить взаимосвязь развития рака желчных протоков (холангиокарциномы) и описторхоза, вызванного гельминтами, в частности, сибирским сосальщиком (Opisthorchis felineus). Сейчас при участии СибГМУ идет набор пациентов для подтверждения результатов  и поиска метаболических паттернов, характерных для рака, вызванного гельминтной инфекцией. Всего планируется исследовать около 350 человек с холангиокарциономой.

– Проект имеет и более долгосрочные перспективы: мы планируем создать первый сибирский центр метаболического фенотипирования, целью которого будет комплексная оценка здоровья людей, живущих в регионе, и рисков для него, – поясняет руководитель проекта, заведующий лабораторией клинической метаболомики ТГУ Олег Майборода.

Проект  – часть инициативы международного консорциума Tomsk Opisthorchiasis Consortium (TOPIC). Он рассчитан на два года, реализуется при поддержке гранта Фонда Менделеева ТГУ и должен завершиться в 2016 году. По теме проекта опубликованы статьи в журналах European Journal of Cancer Supplements, International Journal for Parasitology, Journal of Proteome  Research. Сейчас ученые также готовят ряд публикаций.